Princípom návrhu vysoko rozpustnej multifunkčnej knižnice fragmentov je umožniť rýchlu a lacnú následnú syntézu na poskytnutie rýchlych údajov SAR. Pripravené fragmenty obsahujú aspoň jednu funkčnú skupinu, ktorá sa môže syntetizovať pomocou robustnej, dobre charakterizovanej reakcie. Reakcie zahŕňajú amidové kondenzácie, arylarylové kondenzácie Suzukiho typu a redukčné aminácie. Fragmentová knižnica obsahuje 1159 druhov fragmentových molekúl. Knižnica multifunkčných fragmentov s vysokou rozpustnosťou je navrhnutá analýzou priestorovej stability všetkých komerčne dostupných fragmentov a výberom chemicky rôznorodej podskupiny. Aby sa zvýšila rozmanitosť knižnice zlúčenín, boli starostlivo vybrané niektoré ďalšie nasýtené heterocyklické zlúčeniny na doplnenie knižnice zlúčenín.
Knižnica fragmentov štruktúrnej diverzity s vysokou rozpustnosťou je konštruovaná efektívnym a modulárnym spôsobom, takže je veľmi vhodná na riešenie súčasnej situácie, že na dosiahnutie viacsmerného rastu fragmentov je potrebné veľké množstvo syntetických investícií. Štruktúrne odlišné fragmenty sú navrhnuté tak, aby obsahovali vhodné syntetické reaktívne skupiny pre budúci rast fragmentov. Knižnica vysoko rozpustných fragmentov 3D štruktúrnej diverzity obsahuje 1081 zlúčenín.
Dizajn liekov založený na fragmentoch zaviedol proces vývoja liekov zdola nahor so zlepšeným odberom vzoriek chemického priestoru a zvýšenou účinnosťou pri včasnom objavovaní liekov. Pri tejto knižnici je kombinované použitie farmakofórov, najvšeobecnejšia koncepcia reprezentujúca interakciu liečivo-cieľ s teóriou proteínových hotspotov, aby sa vyvinul návrhový protokol pre knižnice fragmentov. Prístup SpotXplorer zostavuje knižnice malých fragmentov, ktoré maximalizujú pokrytie experimentálne potvrdených
Knižnica fragmentov FragLite s vysokou rozpustnosťou obsahuje malé halogénované fragmenty a halogénované peptidové mimické fragmenty. FragLites sú malé halogénované fragmenty, ktoré možno použiť na efektívne mapovanie liekových interakcií v nových proteínoch. PepLites je napodobenina malého halogénovaného peptidu, navrhnutá súbežne s FragLites, aby pokryla širšiu škálu liekových interakcií v nových proteínoch. Vysoko rozpustná knižnica halogénovaných fragmentov obsahuje 796 zlúčenín halogénovaných fragmen
Knižnica fragmentov TargetMol's Fragment Library Plus zhromažďuje 2731 fragmentom podobných malých molekúl, ktoré spĺňajú prísne Astexovo pravidlo troch kritérií (MW≤300, cLogP≤3, donory väzieb H≤3 akceptory väzieb H≤3) na objavovanie liečiv na báze fragmentov.
Keďže skríning elektrofilných fragmentov sa stal sľubnou alternatívou k objavovaniu a overovaniu nových cieľov a generovaniu životaschopných chemických východiskových bodov, bola navrhnutá mini elektrofilná heterocyklická knižnica fragmentov. Tieto zlúčeniny sú v podstate kovalentné MiniFragy, ktoré obsahujú päť- a šesťčlenné heterocykly obsahujúce dusík s vlastnosťami priťahujúcimi elektróny, ktoré môžu aktivovať malé elektrofilné substituenty (halogénové, etinylové, vinylové a nitrilové skupiny). Knižni
Knižnica zlúčenín vysoko rozpustných mikrofragmentov pozostáva z 1082 fragmentov s nízkou molekulovou hmotnosťou. Nízkomolekulárne zlúčeniny (takzvané mikrofragmenty) sú odvodené z komerčne dostupných fragmentových priestorov. Dôraz je kladený na zabezpečenie chemickej stability zlúčeniny, neprítomnosti reaktívnych zlúčenín, splnenie fyzikálnych a chemických charakteristík skríningu, štrukturálnej rozmanitosti zlúčenín/pokrytie širšieho chemického priestoru.
Aby bol splnený vysoký dopyt po nových a malých fragmentoch karboxylových kyselín pre FBDD (Fragment-based drug discovery), starostlivo bola vytvorená knižnica 1807 rozpustných fragmentov karboxylových kyselín. Celkovo majú molekuly fragmentov karboxylových kyselín veľký potenciál pri objavovaní liekov, nových a zložitých cieľov, ako sú napríklad interakcie proteín-proteín, vďaka väzbovej afinite k takzvaným „hot-spot“ zvyškom. Rozpustnosť je jednou zo základných fyzikálno-chemických vlastností kandidátsk
Objav liekov založený na fragmentoch (Fragment-based drug discovery FBDD) sa v poslednom desaťročí objavil ako silný nástroj na objavovanie potenciálnych liekov. FBDD zohralo úlohu pri objavení 3 schválených liekov (Vemurafenib, Venetoclax a Erdafitinib) a najmenej 30 liekov, ktoré sú v rôznych štádiách klinického vývoja. Prístup založený na fragmentoch je obzvlášť cenný pre náročnejšie triedy nových cieľov (alebo „nevyliečiteľných“ cieľov), kde už konvenčný skríning (HTS) zlyhal. Knižnica liekových fragm
Bola navrhnutá kovalentná knižnica špecifická pre cysteín. Elektrofilná hlavica fragmentov je akrylamid alebo chlóracetamid (25 % a 75 % knižnice). Tieto funkčné skupiny boli vybrané na vytvorenie knižnice zlúčenín, pretože sú v najlepšej pozícii pre reaktivitu a vykazujú selektivitu pri skríningu chemickej proteomiky. Cysteínová kovalentná knižnica obsahuje 72 zlúčenín.
Objavovanie liečiv na základe fragmentov (FBDD) sa v poslednom desaťročí stalo účinným nástrojom na objavovanie nových liečiv. FBDD zohrala úlohu pri objavovaní najmenej 30 liekov, ktoré sú v rôznych štádiách klinického vývoja, a praktikov FBDD možno nájsť na celom svete v akademickom aj priemyselnom prostredí. Na rozdiel od HTS sa pri FBDD hľadajú hity podobné fragmentom (molekulová hmotnosť nižšia ako 300), ktoré sa zvyčajne viažu s nízkou afinitou; preto sú potrebné citlivé metódy detekcie, ako napríkl
Táto knižnica pozostáva z 990 zlúčenín bez kompromisov v počte cieľov, ale s jedinečnejšími štruktúrami ako známe liečivá a viac informáciami o bioaktivite ako zlúčeniny podobné liečivám. Predpokladá sa, že pomáha vytvárať vyššiu mieru zásahov a je to výkonná knižnica zlúčenín na objavovanie liekov a identifikáciu cieľov.
Knižnica zlúčenín s hematopoetickou toxicitou predstavuje zbierku 104 zlúčenín s definovanou a rôznorodou hematopoetickou toxicitou, vrátane myelosupresie, neutropénie, leukopénie, anémie a mnohých ďalších. Bioaktivita všetkých zlúčenín bola potvrdená biologickými skúškami a uvedená vo vedeckej literatúre. Niektoré z nich sú schválené FDA. Knižnica je základným nástrojom pre prediktívny toxikologický skríning a vývoj testov.
Historicky boli prírodné produkty pokladnicou farmácie. Knižnica pozostáva z viac ako 3745 členov patriacich do 22 skeletov (priemerne 180 zlúčenín na skelet). Knižnica obsahuje nasledujúce podknižnice: 1.Podknižnica na báze cytizínu 2.Matrinová podknižnica 3. Podknižnica na báze podofylotoxínov 4. Podknižnica založená na prirodzene sa vyskytujúcich privilegovaných BBS, ako sú hydroxyprolíny, triptamín, nor-tropolón a iné.
Ako jedinečné odvetvie v oblasti tradičnej čínskej medicíny (TCM) má etnomedicína Yao dlhú históriu s pozoruhodnými etnickými, tradičnými a regionálnymi charakteristikami. Počas dlhých rokov lekárskej praxe lekári Yao rozdelili tradičné etnomedicíny Yao na „teplé“, „horúce“, „studené“, „chladné“ a „ploché“ podľa ich vlastností. Vedci vykonali niekoľko štúdií o etnomedicíne Yao a boli prekvapení jej cytotoxicitou voči rakovinovým bunkovým líniám. Tieto štúdie poskytli dôkazy na pomoc klinickej praxi Yao et
Cytokíny sú široká kategória malých proteínov (~ 5–20 kDa), ktoré sú dôležité v bunkovej signalizácii, modulujú rovnováhu medzi humorálnymi a bunkovými imunitnými odpoveďami a sú vo veľkej miere zapojené do autoimunitných a zápalových ochorení. Blokovanie cytokínových signálnych dráh biologickými látkami preukázalo klinickú účinnosť pri týchto ochoreniach. Knižnica inhibítorov cytokínov od spoločnosti TargetMol, ktorá obsahuje 613 zlúčenín zameraných na cytokínovú signalizáciu, sa môže použiť na skríning