Knižnica fragmentov štruktúrnej diverzity s vysokou rozpustnosťou je konštruovaná efektívnym a modulárnym spôsobom, takže je veľmi vhodná na riešenie súčasnej situácie, že na dosiahnutie viacsmerného rastu fragmentov je potrebné veľké množstvo syntetických investícií. Štruktúrne odlišné fragmenty sú navrhnuté tak, aby obsahovali vhodné syntetické reaktívne skupiny pre budúci rast fragmentov. Knižnica vysoko rozpustných fragmentov 3D štruktúrnej diverzity obsahuje 1081 zlúčenín.
Dizajn liekov založený na fragmentoch zaviedol proces vývoja liekov zdola nahor so zlepšeným odberom vzoriek chemického priestoru a zvýšenou účinnosťou pri včasnom objavovaní liekov. Pri tejto knižnici je kombinované použitie farmakofórov, najvšeobecnejšia koncepcia reprezentujúca interakciu liečivo-cieľ s teóriou proteínových hotspotov, aby sa vyvinul návrhový protokol pre knižnice fragmentov. Prístup SpotXplorer zostavuje knižnice malých fragmentov, ktoré maximalizujú pokrytie experimentálne potvrdených
Knižnica fragmentov FragLite s vysokou rozpustnosťou obsahuje malé halogénované fragmenty a halogénované peptidové mimické fragmenty. FragLites sú malé halogénované fragmenty, ktoré možno použiť na efektívne mapovanie liekových interakcií v nových proteínoch. PepLites je napodobenina malého halogénovaného peptidu, navrhnutá súbežne s FragLites, aby pokryla širšiu škálu liekových interakcií v nových proteínoch. Vysoko rozpustná knižnica halogénovaných fragmentov obsahuje 796 zlúčenín halogénovaných fragmen
Knižnica fragmentov TargetMol's Fragment Library Plus zhromažďuje 2731 fragmentom podobných malých molekúl, ktoré spĺňajú prísne Astexovo pravidlo troch kritérií (MW≤300, cLogP≤3, donory väzieb H≤3 akceptory väzieb H≤3) na objavovanie liečiv na báze fragmentov.
Princípom návrhu vysoko rozpustnej multifunkčnej knižnice fragmentov je umožniť rýchlu a lacnú následnú syntézu na poskytnutie rýchlych údajov SAR. Pripravené fragmenty obsahujú aspoň jednu funkčnú skupinu, ktorá sa môže syntetizovať pomocou robustnej, dobre charakterizovanej reakcie. Reakcie zahŕňajú amidové kondenzácie, arylarylové kondenzácie Suzukiho typu a redukčné aminácie. Fragmentová knižnica obsahuje 1159 druhov fragmentových molekúl. Knižnica multifunkčných fragmentov s vysokou rozpustnosťou je
Keďže skríning elektrofilných fragmentov sa stal sľubnou alternatívou k objavovaniu a overovaniu nových cieľov a generovaniu životaschopných chemických východiskových bodov, bola navrhnutá mini elektrofilná heterocyklická knižnica fragmentov. Tieto zlúčeniny sú v podstate kovalentné MiniFragy, ktoré obsahujú päť- a šesťčlenné heterocykly obsahujúce dusík s vlastnosťami priťahujúcimi elektróny, ktoré môžu aktivovať malé elektrofilné substituenty (halogénové, etinylové, vinylové a nitrilové skupiny). Knižni
Knižnica zlúčenín vysoko rozpustných mikrofragmentov pozostáva z 1082 fragmentov s nízkou molekulovou hmotnosťou. Nízkomolekulárne zlúčeniny (takzvané mikrofragmenty) sú odvodené z komerčne dostupných fragmentových priestorov. Dôraz je kladený na zabezpečenie chemickej stability zlúčeniny, neprítomnosti reaktívnych zlúčenín, splnenie fyzikálnych a chemických charakteristík skríningu, štrukturálnej rozmanitosti zlúčenín/pokrytie širšieho chemického priestoru.
Aby bol splnený vysoký dopyt po nových a malých fragmentoch karboxylových kyselín pre FBDD (Fragment-based drug discovery), starostlivo bola vytvorená knižnica 1807 rozpustných fragmentov karboxylových kyselín. Celkovo majú molekuly fragmentov karboxylových kyselín veľký potenciál pri objavovaní liekov, nových a zložitých cieľov, ako sú napríklad interakcie proteín-proteín, vďaka väzbovej afinite k takzvaným „hot-spot“ zvyškom. Rozpustnosť je jednou zo základných fyzikálno-chemických vlastností kandidátsk
Objav liekov založený na fragmentoch (Fragment-based drug discovery FBDD) sa v poslednom desaťročí objavil ako silný nástroj na objavovanie potenciálnych liekov. FBDD zohralo úlohu pri objavení 3 schválených liekov (Vemurafenib, Venetoclax a Erdafitinib) a najmenej 30 liekov, ktoré sú v rôznych štádiách klinického vývoja. Prístup založený na fragmentoch je obzvlášť cenný pre náročnejšie triedy nových cieľov (alebo „nevyliečiteľných“ cieľov), kde už konvenčný skríning (HTS) zlyhal. Knižnica liekových fragm
Bola navrhnutá kovalentná knižnica špecifická pre cysteín. Elektrofilná hlavica fragmentov je akrylamid alebo chlóracetamid (25 % a 75 % knižnice). Tieto funkčné skupiny boli vybrané na vytvorenie knižnice zlúčenín, pretože sú v najlepšej pozícii pre reaktivitu a vykazujú selektivitu pri skríningu chemickej proteomiky. Cysteínová kovalentná knižnica obsahuje 72 zlúčenín.
Prírodné produkty sú neprekonateľným zdrojom chemickej diverzity a ideálnym východiskovým bodom pre akýkoľvek skríningový program pre farmakologicky aktívne malé molekuly. Historicky najúspešnejším zdrojom nových liekov boli prírodné produkty. Prírodné produkty sa ukázali ako úspešné modulátory zložitých cieľov, ako je rad antibakteriálnych cieľov a najmä interakcie proteín-proteín. Knižnica vzácnych prírodných produktov od spoločnosti TargetMol, predstavuje jedinečnú zbierku 178 vzácnych prírodných prod
Objavovanie liečiv na základe fragmentov (FBDD) sa v poslednom desaťročí stalo účinným nástrojom na objavovanie nových liečiv. FBDD zohrala úlohu pri objavovaní najmenej 30 liekov, ktoré sú v rôznych štádiách klinického vývoja, a praktikov FBDD možno nájsť na celom svete v akademickom aj priemyselnom prostredí. Na rozdiel od HTS sa pri FBDD hľadajú hity podobné fragmentom (molekulová hmotnosť nižšia ako 300), ktoré sa zvyčajne viažu s nízkou afinitou; preto sú potrebné citlivé metódy detekcie, ako napríkl
Cieľový vysokovýkonný skríning je kľúčovou stratégiou pri objavovaní liekov a používanie jednocieľovej knižnice na skríning je bežnou praxou. Má však obmedzenia: 1) relatívne obmedzený počet zlúčenín, 2) nevhodné pre štúdie s viacerými cieľmi, 3) prílišné zdôrazňovanie špecifického cieľa môže prehliadnuť iné chemicky nepreskúmané štruktúry 4) použiteľné iba na jediný účel skríningu (nižšie využitie a vyššie náklady). Naproti tomu skríning založený na fenotype so širším pokrytím cieľov výrazne zvyšuje
Táto knižnica pozostáva z 990 zlúčenín bez kompromisov v počte cieľov, ale s jedinečnejšími štruktúrami ako známe liečivá a viac informáciami o bioaktivite ako zlúčeniny podobné liečivám. Predpokladá sa, že pomáha vytvárať vyššiu mieru zásahov a je to výkonná knižnica zlúčenín na objavovanie liekov a identifikáciu cieľov.
Rakovina je dobre známy globálny zdravotný problém, ktorý je zodpovedný za 7,6 milióna úmrtí (13 % všetkých úmrtí) na celom svete a očakáva sa, že do roku 2030 vzrastie na 13,1 milióna. Už dlho sa uznáva, že prírodné produkty predstavujú najbohatší zdroj vysokej chemickej diverzity, ktoré poskytujú základ pre identifikáciu nových štruktúr skeletu, ktoré slúžia ako východiskové body pre racionálny návrh protirakovinových liekov. Podľa nedávneho prehľadu bolo 49 % liekov buď prírodné produkty alebo ich deri
Knižnica zlúčenín s hematopoetickou toxicitou predstavuje zbierku 104 zlúčenín s definovanou a rôznorodou hematopoetickou toxicitou, vrátane myelosupresie, neutropénie, leukopénie, anémie a mnohých ďalších. Bioaktivita všetkých zlúčenín bola potvrdená biologickými skúškami a uvedená vo vedeckej literatúre. Niektoré z nich sú schválené FDA. Knižnica je základným nástrojom pre prediktívny toxikologický skríning a vývoj testov.